Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC97Q96F63 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms