Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFHD2Q96C19 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFHD2Q96C19 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms