Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF548Q8NEK5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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ZNF548Q8NEK5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF548Q8NEK5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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