Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APCDD1LQ8NCL9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APCDD1LQ8NCL9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms