Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD163Q86VB7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms