Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC84Q86UT8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC84Q86UT8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC84Q86UT8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms