Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPRIN2Q6IMN6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms