Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNF220Q5VTB9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms