Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms