Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms