Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC142Q17RM4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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