Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCSK7Q16549 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms