Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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