Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE3CQ15386 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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