Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHPRHQ149N8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHPRHQ149N8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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