Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1CQ13936 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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