Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXI1Q12951 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXI1Q12951 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms