Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms