Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOBRQ0VD83 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOBRQ0VD83 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms