Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms