Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLGA3Q08378 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms