Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF4Q08170 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms