Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLEQ07864 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLEQ07864 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLEQ07864 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLEQ07864 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms