Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC3A1Q07837 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms