Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FMODQ06828 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FMODQ06828 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms