Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms