Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POU3F1Q03052 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms