Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms