Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IRF8Q02556 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms