Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL7P80098 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL7P80098 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCL7P80098 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms