Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RPS4XP62701 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS4XP62701 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms