Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDST1P52848 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDST1P52848 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDST1P52848 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms