Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms