Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms