Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ITGA4P13612 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms