Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms