Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTAP01040 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTAP01040 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTAP01040 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTAP01040 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTAP01040 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTAP01040 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTAP01040 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTAP01040 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms