Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB2O43741 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB2O43741 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB2O43741 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB2O43741 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKAB2O43741 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms