Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF1O43189 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms