Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM38O00635 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms