Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAPO00193 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAPO00193 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAPO00193 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAPO00193 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAPO00193 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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