Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms