Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PALM3A6NDB9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms