Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HMX2A2RU54 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HMX2A2RU54 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms