Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms