Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRPC4Q9UBN4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRPC4Q9UBN4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms