Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZDHHC3Q9NYG2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms