Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COMMD8Q9NX08 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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