Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS45Q9NRW7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS45Q9NRW7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms