Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB18Q9NP72 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB18Q9NP72 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms